Umeå University is dedicated to providing creative environments for learning and work. We offer a wide variety of courses and programmes, world leading research, and excellent innovation and collaboration opportunities. More than 4 300 employees and 31 500 students have already chosen Umeå University. We welcome your application!

Institutionen för fysiologisk botanik, som är del av Umeå Plant Science Centre (www.

upsc.se), söker en forskningsingenjör i bioinformatik. Den huvudsakliga arbetsuppgiften kommer vara att ge stöd till användare av de bioinformatiska resurserna på UPSC. Anställningen är på heltid i ett år, med möjlighet till förlängning. Tillträde snarast. Sista ansökningsdag är 2016-04-18.

Beskrivning

Umeå Plant Science Centre's bioinformatikplattform (UPSCb) önskar anställa en bioinformatiker för att förstärka arbetsgruppen. UPSC's bioinformatikgrupp hade en viktig roll när gran-genomet sekvenserades då som det största genomet alla kategorier som kartlagts. Detta, och andra sekvenseringsprojekt som kräver omfattande bioinformatik, har gjort att vi nu etablerat en Bioinformatik-plattform som har en ledande roll i flera stora projekt. UPSCb har utvecklat och tillhandahåller flera forskningsresurser t.ex. web-baserade applikationer såsom Plant Genome Integrative Explorer (PlantGenIE). Vi söker nu en bioinformatiker för att hjälpa oss att fortsätta utveckla dessa resurser, samt att ge support till forskarna som använder dem.

Arbetsuppgifter

Arbetsuppgifterna omfattar analys av High Throughput Sequencing (i huvudsak RNA-seq) data, – d.v.s. användning av vår pipeline för dataförbehandling, kvalitetskontroll, resultatframställning och presentation. I vissa fall blir du mer delaktig i vissa forskningsprojekt, till exempel genom att vid analysen samarbeta med forskare med mindre bioinformatikkompetens (att hjälpa biologer med att t.ex. söka sekvenshomologer, utföra fylogenetiska analyser osv.). I arbetet ingår även  att upprätthålla IT-infrastrukturen, exempelvis genom installation av ny programvara, användarhantering och administrering av ett kösystem på våra servrar.

Kvalifikationer

Du har en masterexamen inom beräkningsbiologi, bioinformatik eller motsvarande. Du måste vara väl bekant med Unix/Linux och minst ett programmeringsspråk såsom Python, R, C eller C++. Det är viktigt att du är en lagspelare som tycker om att interagera med biologer (d.v.s. UPSCb’s huvudsakliga användargrupp). Det krävs att du har mycket goda kunskaper i engelska. Erfarenhet av databashantering, systemadministration, NGS teknik och statistik är meriterande.

Ansökan

Ansökan skall innehålla (1) CV och kopior på relevanta examen (2) ett personligt brev med redogörelse av ditt forskningsintresse (3) Kontaktinformation till två referenspersoner.

Institutionen för fysiologisk botanik är en del av Umeå Plant Science Centre med cirka 200 medarbetare som består av bland annat av 40 gruppledare och representerar för närvarande 48 olika nationaliteter (för mer information, se http://www.upsc.se eller http://www.plantphys.umu.se/english/). Vår huvudsakliga verksamhet är akademisk forskning och utbildning som innefattar områden som ekologi, biokemi, plantfysiologi samt genomik. Om du vill har mer information om anställningen, kontakta nicolas.delhomme (at) umu.se eller Stefan.jansson (at) umu.se.

Umeå Unive

Timmar per vecka: 100 %. Tillträde: Snarast Visstidsanställning

Arbetsgivare Namn:
Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Arbetsgivare adress: Umeå universitet 90187 Umeå

Form av kontakt:
Stefan Jansson, prefekt titel : telefon 1: 090-786 5354() telefon 2: () mobil: e-post:

Jobb kort beskrivning:
Biologists, botanists, zoologists and related professionals

Land: Sweden

Område: Västerbottens län

Avtalstid: Permanent

Typ av kontrakt: Full time

Källa till jobberbjudande: Public Employment Service of Sweden(AMS)

Hur man ansöker: Other - see free text